Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Sgo1Q9CXH7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Sgo1Q9CXH7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Sgo1Q9CXH7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Sgo1Q9CXH7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Sgo1Q9CXH7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Sgo1Q9CXH7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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