Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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