Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CWU4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms