Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.2 ms