Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ykt6Q9CQW1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms