Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Chchd5Q9CQP3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms