Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms