Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms