Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms