Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl11Q9CQF0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Mrpl11Q9CQF0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Mrpl11Q9CQF0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Mrpl11Q9CQF0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl11Q9CQF0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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