Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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