Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms