Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Ms4a4dQ99N05 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Ms4a4dQ99N05 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.3 ms