Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tdrd1Q99MV1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tdrd1Q99MV1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tdrd1Q99MV1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tdrd1Q99MV1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tdrd1Q99MV1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tdrd1Q99MV1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tdrd1Q99MV1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tdrd1Q99MV1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tdrd1Q99MV1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tdrd1Q99MV1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tdrd1Q99MV1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tdrd1Q99MV1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms