Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms