Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Abcf2Q99LE6 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Abcf2Q99LE6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Abcf2Q99LE6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Abcf2Q99LE6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Abcf2Q99LE6 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Abcf2Q99LE6 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Abcf2Q99LE6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Abcf2Q99LE6 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf2Q99LE6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms