Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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