Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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