Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms