Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usb1Q91W78 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usb1Q91W78 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usb1Q91W78 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms