Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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