Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q8VDP2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q8VDP2 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q8VDP2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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