Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms