Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms