Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms