Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Vmn1r200Q8R281 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Vmn1r200Q8R281 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Vmn1r200Q8R281 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Vmn1r200Q8R281 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Vmn1r200Q8R281 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Vmn1r200Q8R281 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Vmn1r200Q8R281 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Vmn1r200Q8R281 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Vmn1r200Q8R281 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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