Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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Hoxc12Q8K5B8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Hoxc12Q8K5B8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Hoxc12Q8K5B8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Hoxc12Q8K5B8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Hoxc12Q8K5B8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Hoxc12Q8K5B8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Hoxc12Q8K5B8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Hoxc12Q8K5B8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Hoxc12Q8K5B8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Hoxc12Q8K5B8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc12Q8K5B8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Hoxc12Q8K5B8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Hoxc12Q8K5B8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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