Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Vmn1r188Q8K3N2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Vmn1r188Q8K3N2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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