Protein–RNA interactions for Protein: Q8K387

Usp45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp45Q8K387 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms