Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms