Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek9Q8K1R7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms