Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sde2Q8K1J5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.8 ms