Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0F1

Tbc1d23, TBC1 domain family member 23, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d23Q8K0F1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d23Q8K0F1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms