Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms