Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm28Q8CGC6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm28Q8CGC6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm28Q8CGC6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm28Q8CGC6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm28Q8CGC6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm28Q8CGC6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm28Q8CGC6 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm28Q8CGC6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm28Q8CGC6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm28Q8CGC6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm28Q8CGC6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm28Q8CGC6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm28Q8CGC6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm28Q8CGC6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm28Q8CGC6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm28Q8CGC6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm28Q8CGC6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rbm28Q8CGC6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms