Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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