Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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