Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms