Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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Gm9955Q8CEJ8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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Gm9955Q8CEJ8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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Gm9955Q8CEJ8 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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Gm9955Q8CEJ8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Gm9955Q8CEJ8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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