Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Usp27Q8CEG8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Usp27Q8CEG8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp27Q8CEG8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp27Q8CEG8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp27Q8CEG8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp27Q8CEG8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Usp27Q8CEG8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Usp27Q8CEG8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Usp27Q8CEG8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Usp27Q8CEG8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Usp27Q8CEG8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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