Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CcinQ8CDE2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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