Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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