Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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