Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms