Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Atg16l1Q8C0J2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Atg16l1Q8C0J2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Atg16l1Q8C0J2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Atg16l1Q8C0J2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Atg16l1Q8C0J2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Atg16l1Q8C0J2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Atg16l1Q8C0J2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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Atg16l1Q8C0J2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg16l1Q8C0J2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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