Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtpaQ8BWP5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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TtpaQ8BWP5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TtpaQ8BWP5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TtpaQ8BWP5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TtpaQ8BWP5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TtpaQ8BWP5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms