Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

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Length 1,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ssc5dQ8BV57 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ssc5dQ8BV57 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Ssc5dQ8BV57 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Ssc5dQ8BV57 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Ssc5dQ8BV57 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ssc5dQ8BV57 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ssc5dQ8BV57 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ssc5dQ8BV57 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ssc5dQ8BV57 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ssc5dQ8BV57 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ssc5dQ8BV57 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc5dQ8BV57 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ssc5dQ8BV57 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms