Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8BP99 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8BP99 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8BP99 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8BP99 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8BP99 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8BP99 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8BP99 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8BP99 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8BP99 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8BP99 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8BP99 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8BP99 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8BP99 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8BP99 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8BP99 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8BP99 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8BP99 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8BP99 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8BP99 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8BP99 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8BP99 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8BP99 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8BP99 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Q8BP99 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Q8BP99 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Q8BP99 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Q8BP99 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Q8BP99 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Q8BP99 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Q8BP99 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Q8BP99 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8BP99 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Q8BP99 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Q8BP99 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Q8BP99 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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