Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf41Q8BH75 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf41Q8BH75 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf41Q8BH75 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms