Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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